• Fiskeridirektoratet Region Trøndelag
• Fiskeridirektoratet Region Møre og Romsdal

1. januar 2016 har Fiskeridirektoratet fem regionar mot sju i dag. Samstundes vil enkelte arbeidsoppgåver bli flytta frå hovudkontoret i Bergen til regionane.
Region Finnmark og region Troms blir frå nyttår samla til region Nord med leiinga i Tromsø. Region Trøndelag og region Møre og Romsdal blir region Midt med leiinga i Ålesund.
Kilde: http://www.fiskeridir.no/Om-oss/Organisering/Ny-regionstruktur-i-Fiskeridirektoratet

Fiskerikontor 2016:
• FISKERIKONTORET FOSNAVÅG
• FISKERIKONTORET KRISTIANSUND
• FISKERIKONTORET RØRVIK
• FISKERIKONTORET SISTRANDA
• REGIONKONTORET TRONDHEIM
• REGIONKONTORET ÅLESUND

Fiskeridirektoratet ny organisering 1.11.2022.

Fiskeridirektoratet organiseres etter funksjoner. En funksjonsorganisering betyr at direktoratet ikke lenger vil ha et hovedkontor og fem regioner.

Fiskeridirektoratet går fra å ha et hovedkontor i Bergen og fem regioner, til to nasjonale divisjoner. Divisjonene er delt mellom forvaltningsoppgaver og kontroll- og tilsynsoppgaver.

Det skal opprettes tre lederklynger i henholdsvis Bergen (hovedkontor), Bodø og Tromsø. Fra 1. november vil det bli opprettet to landsdekkende divisjoner, en for forvaltning og en for kontroll og tilsyn. Ledelse for forvaltningsdivisjonen skal ha kontorsted i Tromsø, mens ledelsen for kontroll og tilsyn skal ha kontorsted i Bodø. I tillegg skal ledelsen for fartøy og deltakerseksjonen ligge i Vadsø og ledelsen for seksjon for reaksjoner skal ligge i Ålesund.

Direktoratet viderefører sine 20 kontorer langs hele kysten fra Vadsø i nord til Fredrikstad i sør.

Kontorene med flest ansatte er fortsatt Tromsø, Bodø, Ålesund, Måløy, Bergen og Egersund.

Fiskeridirektoratet har også kontorer i Vadsø, Båtsfjord, Honningsvåg, Hammerfest, Finnsnes, Sortland, Svolvær, Leknes, Sandnessjøen, Rørvik, Trondheim, Kristiansund, Kopervik og Fredrikstad.