Det sammenslåtte Troms og Finnmark fylkes splittes opp igjen og Kautokeino kommune, hvor virksomheten er lokalisert, får nytt kommunenummer i et gjenopprettet Finnmark fylke; fra 5430 til 5612.

Fra 1. januar ble de samiske videregående skoler i Karasjok og Kautokeino etatsstyrt av Kunnskapsdepartementet

De samiske videregående skoler i Karasjok og Kautokeino er fra 2020 ikke lenger underlagt Utdanningsdirektoratet men direkte underlagt Kunnskapsdepartementet.

KUNNSKAPSDEPARTEMENTET
- DE SAMISKE VIDEREGÅENDE SKOLER, KARASJOK OG KAUTOKEINO
-- SAMISK VIDEREGÅENDE SKOLE KARASJOK
-- SAMISK VIDEREGÅENDE SKOLE OG REINDRIFTSSKOLE KAUTOKEINO

Troms og Finnmark fylker slås sammen og Kautokeino kommune får nytt kommunenummer, 2011 erstattes av 5430.

• Samisk videregående skole, Kautokeino / Sami joatkkaskuvla, Guovdageainnu
• Statens reindriftsskole

Fra 1988 ble Statens reindriftskole slått sammen med Den samiske videregående skole, Kautokeino under navnet Samisk videregående skole og reindriftsskole, Kautokeino. Den nye skolen fikk da et felles styre.