Kontorene ble opprettet på 1960-tallet; se historikk under:

1964:
Økonomisk kartlegging ble satt i gang etter en samlet plan i 1964 og fylkeskartkontorene ble opprettet under fylkeskommunene. I 1977 ble de overført til staten og direkte underlagt Miljøverndepartementet.

1982:
Fylkeskartkontorene blir fra 1982 organisert som egne kontorer innen Fylkesmannens Miljøvernavdelinger.

1986:
Fra 1986 blir fylkeskartkontorene tilknyttet Statens kartverk når det gjaldt faglige spørsmål samt budssjett- og personalansvar.

1994:
Spørsmålet om kartkontorenes administrative tilknytning ble utredet i en egen arbeidsgruppe. I tråd med flertallet i denne gruppen kom regjeringen til at kartkontorene skulle få rene kommandolinjer til Kartverket, og at den parallelle tilknytningen til fylkesmannen burde opphøre samtidig med at Kartverket ble omdannet til forvaltningsbedrift.