Spesialenheten for politisaker ble opprettet 1. januar 2005, etter en omorganisering og avvikling av de tidligere Særskilte etterforskningsorganene (SEFO). Spesialenheten har som oppgave å lede etterforskningen av embets- og tjenestemenn i politiet og påtalemyndigheten som er anmeldt for straffbare forhold i tjenesten.

Spesialenheten skal videre lede etterforskningen når påtalemyndigheten finner at det er mistanke om straffbare handlinger begått av ansatte i politiet eller påtalemyndigheten i tjeneste, og når en slik mistenkt selv begjærer etterforskning, jf. lov av 5. mars 2004 nr. 13, endringer i straffeprosesslovens § 59-67.

Spesialenheten er organisert med en sentral stab på Hamar, men med fem regionale ledd:

- Region nord (Nordland, Troms og Finnmark) - lokalisert i Bodø
- Region Midt-Norge (Møre og Romsdal, Sør-Trøndelag og Nord-Trøndelag) - lokalisert i Trondheim
- Region vest (Hordaland og Sogn og Fjordane) _ lokalisert i Bergen
- Region sør (Aust-Agder, Vest-Agder og Rogaland) - lokalisert i Haugesund
- Region øst (Østfold, Hedmark, Oppland, Akershus, Oslo, Buskerud, Vestfold og Telemark) - samlokalisert med den sentrale staben på Hamar

Spesialenheten ledes pr 2005 av Jan Egil Presthus, og hver øvrig region ledes av en jurist utnevnt på verv for fireårsperioder. Leder av Region øst er fast ansatt, med bakgrunn i at saksmengden i denne regionen erfaringsmessig har vært størst.

Det er knyttet fast ansatte etterforskere til sentral stab og regionene for øvrig, og siktemålet med organiseringen av regionale ledd har vært å sikre at Spesialenheten kan rykke hurtig ut til etterforskning i aktuelle saker.